O projektu

Nové genetické metody umožňují analyzovat celá mikrobiální společenstva bez potřeby kultivace jednotlivých mikroorganismů ve speciálních podmínkách. Souhrnná genetická informace mikrobiálních komunit je označována jako mikrobiom. Díky tomu se výrazně posunula naše představa o lidské mikrobiotě. Každý člověk je obýván miliardami buněk mikroorganismů z různých skupin. Většina těchto mikroorganismů jsou druhy specializované na život v lidském těle. Podílí se na mnoha zásadních funkcích lidského těla jako je formování imunity, obrana před patogeny nebo produkce vitamínů, ale mají vliv například i na deprese nebo různé metabolické poruchy. Vědci objevují neustále nové způsoby jakými mikroorganismy interagují se svými hostiteli a jak mohou ovlivnit naše zdraví.

Nově existuje možnost zjistit mikrobiální profil z určitého typu vzorku od pacienta a posoudit ho podle známých asociacií s různými zdravotními stavy. Alternativně lze takový typ vzorku použít pro vyšetření při podezření na přítomnost nějakého konkrétního patogenu. Nejprostudovanější jsou z tohoto pohledu bakteriální komunity stolice. Mikrobiom stolice odráží situaci v tlustém střevě. Výhodou je, že vzorek lze snadno získat neinvazivní cestou. Mezi další běžně odebírané vzorky pro studium mikrobiomu patří moč, sliny nebo výtěry z pochvy a stěry z kůže.